Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GEMP55040 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GEMP55040 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GEMP55040 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEMP55040 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms