Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNB3P54284 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms