Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MVDP53602 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MVDP53602 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MVDP53602 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MVDP53602 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MVDP53602 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms