Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUCLG1P53597 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms