Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms