Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LUMP51884 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LUMP51884 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LUMP51884 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LUMP51884 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LUMP51884 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LUMP51884 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LUMP51884 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LUMP51884 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LUMP51884 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LUMP51884 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LUMP51884 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LUMP51884 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms