Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DAP3P51398 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DAP3P51398 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DAP3P51398 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DAP3P51398 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms