Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYB561P49447 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYB561P49447 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYB561P49447 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYB561P49447 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYB561P49447 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYB561P49447 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CYB561P49447 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CYB561P49447 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYB561P49447 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYB561P49447 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYB561P49447 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYB561P49447 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYB561P49447 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYB561P49447 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYB561P49447 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYB561P49447 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYB561P49447 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms