Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NEDD4P46934 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms