Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHKA1P46020 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms