Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTR1BP42025 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms