Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms