Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP214P35658 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms