Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms