Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSG3P32926 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DSG3P32926 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG3P32926 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG3P32926 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG3P32926 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG3P32926 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG3P32926 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG3P32926 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSG3P32926 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSG3P32926 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG3P32926 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms