Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBEC3AP31941 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms