Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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