Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms