Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
HOXA13P31271 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA13P31271 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA13P31271 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA13P31271 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA13P31271 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA13P31271 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms