Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXA10P31260 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms