Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASP1P29466 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP1P29466 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms