Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms