Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX2P28328 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX2P28328 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms