Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCP25054 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCP25054 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCP25054 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
APCP25054 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APCP25054 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APCP25054 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APCP25054 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APCP25054 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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