Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms