Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms