Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRHP20396 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRHP20396 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRHP20396 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRHP20396 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRHP20396 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRHP20396 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRHP20396 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRHP20396 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRHP20396 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRHP20396 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms