Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms