Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms