Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF3P17036 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms