Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB1P16220 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CREB1P16220 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms