Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms