Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms