Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMP4P12644 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
BMP4P12644 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMP4P12644 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMP4P12644 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms