Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODC1P11926 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODC1P11926 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODC1P11926 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODC1P11926 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODC1P11926 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ODC1P11926 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms