Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP1P11387 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP1P11387 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP1P11387 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP1P11387 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP1P11387 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP1P11387 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP1P11387 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TOP1P11387 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TOP1P11387 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms