Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4AP0C0L4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms