Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTMAP06454 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTMAP06454 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTMAP06454 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms