Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
F13BP05160 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
F13BP05160 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
F13BP05160 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
F13BP05160 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
F13BP05160 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
F13BP05160 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
F13BP05160 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
F13BP05160 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms