Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DQB1P01920 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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