Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBTB3O94955 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms