Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRMUO75648 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRMUO75648 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRMUO75648 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRMUO75648 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRMUO75648 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms