Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 GUSBP11-203ENST00000445682 3350 ntTSL 214.38□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 132
SF3B1O75533 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 132
SF3B1O75533 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 132
SF3B1O75533 LAMTOR4-212ENST00000494136 427 ntTSL 29.27□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 132
SF3B1O75533 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 132
SF3B1O75533 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 132
SF3B1O75533 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 132
SF3B1O75533 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 132
SF3B1O75533 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 132
SF3B1O75533 NUDCD3-205ENST00000472246 570 ntTSL 410.85□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 131.9
SF3B1O75533 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.431e-8■■■■■ 131.9
SF3B1O75533 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 131.9
SF3B1O75533 CLYBL-201ENST00000339105 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 131.9
SF3B1O75533 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 131.9
SF3B1O75533 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.666e-7■■■■■ 131.8
SF3B1O75533 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 522.02■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 SLC39A11-213ENST00000582769 567 ntTSL 513.98□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 ENTPD1-AS1-204ENST00000427846 749 ntTSL 211.39□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 ENTPD1-AS1-211ENST00000454638 2933 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 ATP6V1A-204ENST00000470455 2266 ntTSL 28.82□□□□□ -14e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.394e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.454e-6■■■■■ 131.7
SF3B1O75533 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 CALML4-202ENST00000395463 1445 ntTSL 1 (best)15.77■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 AC107871.1-204ENST00000638026 2895 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 CALML4-204ENST00000448060 2520 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 CALML4-208ENST00000540479 4603 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 CALML4-207ENST00000478113 3651 ntTSL 1 (best)4.87□□□□□ -1.633e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PRRG1-206ENST00000484460 582 ntTSL 419.04■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PRRG1-204ENST00000466533 628 ntTSL 318.36■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PRRG1-209ENST00000543642 4509 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PRRG1-207ENST00000491253 650 ntTSL 310.86□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 MBD5-209ENST00000488372 548 ntTSL 42.03□□□□□ -2.082e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 MBD5-210ENST00000496158 544 ntTSL 51.96□□□□□ -2.12e-7■■■■■ 131.6
SF3B1O75533 UBAC2-211ENST00000494576 1855 ntTSL 215.09■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 131.5
SF3B1O75533 EVI5-204ENST00000474806 525 ntTSL 322.51■■□□□ 1.193e-7■■■■■ 131.5
SF3B1O75533 EVI5-202ENST00000466778 321 ntTSL 316.09■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 131.5
SF3B1O75533 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 131.4
SF3B1O75533 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.245e-6■■■■■ 131.4
SF3B1O75533 TOP3A-217ENST00000584582 3661 ntTSL 511.38□□□□□ -0.595e-6■■■■■ 131.4
SF3B1O75533 TOP3A-201ENST00000321105 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 131.4
SF3B1O75533 TOP3A-214ENST00000582981 3239 ntTSL 210.72□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 131.4
SF3B1O75533 TOP3A-209ENST00000580095 2929 ntTSL 1 (best)10.64□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 131.4
SF3B1O75533 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 131.4
SF3B1O75533 ARHGAP21-207ENST00000446003 3859 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 131.4
SF3B1O75533 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 131.4
SF3B1O75533 KLHL23-206ENST00000498202 843 ntTSL 319.79■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 131.3
SF3B1O75533 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 131.3
SF3B1O75533 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.619e-9■■■■■ 131.3
SF3B1O75533 PIGU-201ENST00000217446 1632 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.299e-9■■■■■ 131.3
SF3B1O75533 PIGU-203ENST00000438215 509 ntTSL 310.24□□□□□ -0.779e-9■■■■■ 131.3
SF3B1O75533 PIGU-205ENST00000480175 744 ntTSL 37.79□□□□□ -1.169e-9■■■■■ 131.3
SF3B1O75533 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.751e-6■■■■■ 131.3
SF3B1O75533 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 131.2
SF3B1O75533 ZDHHC7-202ENST00000344861 2727 ntTSL 1 (best)17.3■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 131.2
SF3B1O75533 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 131.2
SF3B1O75533 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 131
SF3B1O75533 MAP3K6-204ENST00000472410 2530 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 SPG7-203ENST00000561702 2042 ntTSL 214.76□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 MBD5-225ENST00000637445 958 ntTSL 59.19□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 131
SF3B1O75533 MBD5-232ENST00000638090 2039 ntTSL 56.97□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 131
SF3B1O75533 MBD5-216ENST00000635796 1371 ntTSL 55.1□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 131
SF3B1O75533 ERCC2-202ENST00000391942 1488 ntTSL 218.22■□□□□ 0.517e-8■■■■■ 131
SF3B1O75533 ERCC2-211ENST00000588652 2405 ntTSL 218.06■□□□□ 0.487e-8■■■■■ 131
SF3B1O75533 GALNT10-206ENST00000519544 744 ntTSL 316.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GRB2-210ENST00000582582 584 ntTSL 411.38□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GRB2-208ENST00000578961 687 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GPATCH8-202ENST00000585614 686 ntTSL 310.27□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GRB2-204ENST00000392563 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GPATCH8-205ENST00000587228 4713 ntTSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GPATCH8-210ENST00000592746 457 ntTSL 54.97□□□□□ -1.614e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GPATCH8-203ENST00000586037 345 ntTSL 54.53□□□□□ -1.684e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 GPATCH8-207ENST00000590041 829 ntTSL 52.96□□□□□ -1.934e-6■■■■■ 131
SF3B1O75533 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.428e-9■■■■■ 130.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1741.9 ms