Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms