Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms