Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC9O60706 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms