Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKNO60260 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKNO60260 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKNO60260 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms