Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TIMM8AO60220 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms