Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DENRO43583 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DENRO43583 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DENRO43583 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DENRO43583 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms