Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6AO15550 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms